Actualmente la Corte viene investigando, de forma preliminar y a solicitud de Uganda y de la República Democrática del Congo, los conflictos armados en esos Estados.

Ambas citaciones han sido remitidas directamente por esos países en enero y en abril de 2004, respectivamente. Esto constituye un avance en materia de cooperación judicial puesto que al hacer esta solicitud, ambos países se comprometen
a colaborar con los funcionarios de la Corte en
las investigaciones, así como ante eventuales detenciones y entregas de potenciales sospechosos.
En el caso de Uganda Uganda, en octubre de 2005 la Fiscalía emitió los primeros cinco mandatos de arresto contra líderes del grupo guerrillero LRA, pero hasta la fecha nadie ha sido detenido y una de estas personas ha fallecido.

Con respecto a la República Democrática del Congo Congo, en marzo de 2006, Thomas Lubanga, líder de la Unión de Patriotas Congoleños, fue detenido y remitido a la Corte, convirtiéndose en el primer proceso de la CPI. Él está siendo procesado por el reclutamiento de niños menores de 15 años para que participen en las hostilidades, lo cual constituye un crimen de guerra de conformidad con el Art.
8 del Estatuto de Roma.

Los potenciales casos que se deberán investigar tienen que ver con denuncias de ataques indiscriminados a la población civil, torturas, desapariciones forzadas, ejecuciones sumarias y crímenes sexuales.

En enero de 2005, la República Centroafricana remitió una solicitud al Fiscal para que investigue los crímenes de su competencia que se puedan haber cometido en este país a partir del 1 de julio de 2002. Ahora le corresponde a la Fiscalía investigar para determinar si existen los méritos suficientes para abrir un caso.

Mediante la Resolución 1593 del 31 de marzo de 2005, el Consejo de Seguridad remitió al Fiscal de la CPI la investigación de los crímenes internacionales cometidos en la región de Darfur Darfur, , Sudán Sudán. Luego de un análisis preliminar, se abrió oficialmente la investigación en junio de 2005 y se esperan los primeros casos para el 2007.